双方协议和三方协议是商务合同中常见的两种形式，它们在法律效力、参与主体、适用范围等方面有着明显的区别。在合同签订前，双方需要充分了解这两种协议的特点和应用场景，以便选择适合自身需求的合同形式。

1、双方协议是指由两方当事人签署的协议，双方之间具有独立的权利和义务在双方协议中，参与主体为两个当事人，一般是买卖双方、委托人和受托人、债务人和债权人等。双方协议主要约定了双方之间的权利义务关系，例如合同的履行方式、支付方式、争议解决方式等。双方在签署协议时应确保协议内容明确详细，避免后期发生纠纷。

2、与双方协议不同，三方协议是由三个当事人共同签署的协议，三方之间形成的权利义务关系更为复杂在三方协议中，各方之间可能出现直接的联系或者间接的联系，需要综合考虑各方的利益和角色。三方协议通常用于涉及多方合作、分工明确的商务合作项目中，例如合资公司的设立、联合投资计划等。在签署三方协议时，各方应当明确自身角色和责任，避免出现利益冲突和合作不畅的情况。

双方协议和三方协议在法律效力上也存在一定差异。双方协议是双方当事人之间达成的合同，其法律效力具有独立性和独立执行性，一般不受到第三方的干扰。而三方协议涉及多方当事人，合同关系更为复杂，其中可能存在多种交叉责任和义务，需要各方共同履行。在法律效力上，三方协议要求各方之间有更高的协调和配合度，以确保合同得到有效执行。

总体而言，双方协议和三方协议在当事人数量、法律效力、协议形式等方面存在着显著的区别。当当事人在商务活动中选择合作形式时，应根据具体情况选择适合的协议形式，并在签署协议前充分考虑各方的权益和责任，以确保合同的有效履行和合作的顺利进行。如有疑问或需要专业意见，建议咨询律师或法律专家进行进一步指导。