对于个人与公司合作协议纠纷，处理方式通常需要依据协议的具体内容、当事人之间的事实情况以及相关的法律法规进行分析，并根据具体情况采取不同的解决途径。下面是我作为八通律师事务所专家对个人与公司合作协议纠纷处理方式的建议：

1、当发生个人与公司合作协议纠纷时，双方应首先尝试通过友好协商的方式解决双方可以通过沟通协商的方式，就纠纷的具体问题进行充分的讨论和理性的交流，寻求双方都可以接受的解决方案。在协商的过程中，可以考虑邀请第三方中立人或专业人士参与调解，协助双方解决分歧，最终达成和解协议。

2、如果协商无果或不能满足一方的合法权益，双方可以考虑通过法律途径解决合作协议纠纷在这种情况下，双方可以寻求法律咨询，并委托律师代表自己进行法律诉讼。律师将帮助当事人分析案件的法律依据，准备相关证据，提起诉讼，代表当事人出庭进行辩护，并帮助当事人争取法律权益。

3、双方也可以考虑通过仲裁机构解决合作协议纠纷

仲裁是一种独立的、有约束力的解决争议的方式，当事人通过协商或者法院判决选择仲裁机构进行仲裁，仲裁庭将依据双方的协议、事实和相关法律规定，公正、独立地进行裁决。

作为律师在处理个人与公司合作协议纠纷时，需要具备扎实的法律知识和丰富的实践经验，能够客观、公正地评估案件的情况，为当事人提供专业的法律建议和协助。同时，律师还应该以维护当事人合法权益为宗旨，积极争取当事人的权益，努力为当事人赢得最大的法律利益。

个人与公司合作协议纠纷的处理方式存在多种途径，当事人可以根据实际情况选择合适的解决方式。作为律师，我们将尽最大努力帮助当事人解决纠纷，维护当事人的合法权益，实现法律正义。