合同是法律关系的载体，它规范了各方之间的权利和义务，具有法律约束力。在实际操作中，有时候各方会在原有合同的基础上达成补充协议，用于进一步明确双方的权利和义务。但如果合同与补充协议存在不一致的情况，这将引发一系列法律问题。

1、在涉及合同与补充协议不一致的情况下，首先需要根据相关法律规定判断补充协议的法律地位根据《中华人民共和国合同法》第11条的规定，当事人可以依照合同的目的、性质和经营习惯订立合同，并且可以约定一些不适用合同法的规定，这些规定应当受到法律保护。因此，补充协议在一定条件下是可以作为合同的一部分并具有法律效力的。

2、在实际操作中，如果合同与补充协议存在不一致的情况，首先需要查看双方的一致意思是否真的产生了补充协议，如果没有，补充协议的法律效力需要重新审视在补充协议与原合同不一致的情况下，需要根据双方的意思是否一致以及实质性是否一致来判断补充协议的效力。如果补充协议与原合同在内容上存在一些冲突，双方必须根据具体情况进行协商和协调，如果无法达成一致，可能需要进行法律诉讼来解决争议。

在处理合同与补充协议不一致的情况下，法律专业人士需要参照相关法律法规，结合双方当事人的意思表示和实质权利义务的一致性，来进行具体的解释和裁决。同时，建议双方当事人应当充分沟通和协商，尽可能在不涉及法律诉讼的前提下解决合同与补充协议不一致的问题。如果双方无法达成一致意见，可能需要寻求法律援助并通过合法途径解决纠纷。

合同与补充协议不一致的情况在实际操作中是可能发生的，这需要依据相关法律规定和双方的意思表示来进行审查和处理。对于合同与补充协议不一致的法律问题，建议双方当事人应当咨询专业法律人士来寻求合法、公正的解决方式，以保障双方的权益和维护法律的权威。